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获取安全且有营养的食物对于维持生命和保持身体健康至关重要。食用被病原体污染的食物会导致从腹泻到癌症等严重疾病。许多食源性感染可导致长期损伤甚至死亡。因此,及早发现食源性病原体(如致病性大肠杆菌菌株)对于公共安全至关重要。检测这些细菌的传统方法基于在选择性培养基上培养并遵循标准生化鉴定。尽管这些方法准确无误,但却非常耗时。基于 PCR 的病原体检测依赖于先进的设备和专业技术人员,而在资源有限的地区很难找到这些设备和技术人员。而 CRISPR 技术对于识别致病细菌更具特异性和灵敏度,因为它采用可编程的 CRISPR-Cas 系统,可针对特定的 DNA 序列,最大限度地减少非特异性结合和交叉反应。在本项目中,开发了一种基于 CRISPR-Cas12a 传感的稳健检测方法,该方法可快速、灵敏且特异性地检测从田纳西州 17 个农场的成年山羊粪便样本中收集的致病性大肠杆菌分离株。检测反应包含致病区域、报告探针、Cas12a 酶和三种致病基因(stx1、stx2 和 hlyA)特有的 crRNA 的扩增 PCR 产物。与致病细菌的 CRISPR 反应在紫外光激发下发出荧光。为了评估该检测的检测灵敏度和特异性,将其结果与基于 PCR 的检测检测进行了比较。两种方法对相同样本的结果相似。该技术非常精确、高度灵敏、快速、经济高效且易于使用,并且可以轻松克服现有检测方法的局限性。该项目可以产生一种多功能的检测方法,该方法易于适应快速响应,以检测和监测对人类健康以及动植物生产造成大规模生物安全威胁的疾病。

基于 CRISPR Cas 系统快速检测致病性大肠杆菌

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