主题领域:生物科学和生物技术 姓名:SANTOS MORENO, JAVIER 参考号:RYC2023-043017-I 电子邮箱:santosmoreno.j@gmail.com 职称:合成生物学家,研究基因回路对细胞行为的编程 履历:我拥有生物技术硕士学位(萨拉曼卡大学)和临床分析实验室硕士学位(庞培法布拉大学)。我在不到 3 年的时间里(2016 年,26 岁)在巴黎(索邦大学巴黎城分校)获得博士学位,研究蛋白质分泌。我研究了细菌(K. oxytoca)II 型分泌系统 (T2SS) 的分子机制,为此我描述了新的蛋白质相互作用并产生了重要的结果,这使我提出了一种新的 T2SS 分泌模型。在瑞士洛桑做博士后期间,我将研究重点从研究现有生物系统转向构建新系统。在研究大肠杆菌的过程中,我率先使用 CRISPRi 构建了一些最重要的合成电路(包括图案化电路、振荡器或双稳态开关),并将这些电路用于不同的应用,包括进化研究、人类病原体(S. penuemoniae)感染研究或细菌细胞生理学的重新编程。我目前在巴塞罗那进行研究,最初以玛丽居里研究员的身份进行,现在以胡安德拉谢尔瓦研究员的身份进行,旨在设计人类皮肤微生物组用于诊断和治疗目的。我成功地将最丰富的皮肤细菌(痤疮梭菌)变成了一种可常规转化的生物体,我为这种细菌开发了第一个分子工具箱(包括启动子、报告基因、转录因子、CRISPR 工具等),并且我构建了一种痤疮梭菌菌株,该菌株在人类皮肤细胞培养物中产生并分泌具有 ROS 清除活性的分子,这在治疗炎症性皮肤病方面具有巨大潜力。2023 年 9 月,我获得了 230 万欧元的 ERC 启动基金。我未来的研究将专注于活细胞中的编程时间。目前,我们对细胞随时间变化进行编程的能力仍然非常有限。我们依靠精确定时的人工干预或控制重复过程的分子振荡器,但我们仍然无法对细胞进行编程以在所需的时间自主执行自定义操作。我现在打算通过在 E. coli 中生成分子计时器来计算时间并在指定时间执行所需的操作,从而朝着这个目标迈出一大步。计时器将具有高度可编程性、可重复使用性和可扩展性,我将使用一种简单而有效的方法将时间可编程性扩展到其他生物体(包括酵母和哺乳动物细胞)。最后,我将利用生物计时器的潜力,将其用于不同的应用,包括:在生物控制中,在期望的时间后进行细胞程序性死亡;精确控制任务执行顺序和时间,用于生物生产;以及在期望的时间窗口内记录(外)细胞事件的“哨兵”细胞,用于生物传感。我的研究结果将释放出无数新的可能性,包括基础的和应用的。例如,在开放或难以接近的环境中(例如农田或受污染的湖泊)部署工程细胞最终可能成为现实,因为任务执行和自我毁灭将被遗传编码为在预定的时间发生。此外,编程的时间指令可以避免在大型生物反应器中对昂贵的诱导信号的需求,或者使研究发育过程时受到的外部干扰最小。总之,我的团队将开发出非常需要的、突破性的测量和编程细胞时间的能力。
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