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机构名称:
¥ 5.0

1 Center for Human Genetics and Genomics, New York University Grossman School of Medicine, USA 2 Department of Pediatrics, Department of Neuroscience & Physiology, Institute for Systems Genetics, Perlmutter Cancer Center, and Neuroscience Institute, New York University Grossman School of Medicine, USA 3 Cryos International Sperm and Egg Bank, Denmark 4 Department of Urology, University Hospitals Cleveland Medical Center, Case Western Reserve University School of Medicine, USA 5 Program美国病儿童医院彼得·吉尔根研究与学习中心,加拿大6. ‡对应:gilad.evrony@nyulangone.org摘要突变在整个生命的每个细胞的基因组中都积累,导致癌症和其他遗传疾病1-4。几乎所有这些镶嵌突变始于DNA的两条链中的核苷酸不匹配或损伤,如果未经修复或误用5。但是,当前的DNA测序技术无法解决这些初始的单链事件。在这里,我们开发了一种单分子的长读测序方法,该方法在存在于DNA的一条或两条链中时,可以实现单基分子的单分子保真度。它还检测到单链胞嘧啶脱氨酸事件,这是一种常见的DNA损伤。我们介绍了来自不同组织的110个样本,包括来自患有癌症的个体综合症的个体,并定义了第一个单链不匹配和损害特征。我们找到了这些单链特征与已知的双链突变特征之间的对应关系,从而解决了起始病变的身份。与仅缺乏聚合酶校对的样品相比,在不匹配修复和复制性聚合酶校对缺乏的肿瘤均显示出独特的单链错配模式。在线粒体基因组中,我们的发现支持一种主要发生在复制过程中的诱变机制。由于先前研究询问的双链DNA突变只是突变过程的终点,因此我们在单分子分辨率下检测启动单链事件的方法将启用有关在多种情况下突变如何在癌症和年龄中出现的新研究。

单分子DNA测序揭示的单链不匹配和损害模式

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