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基因语法 - 基因的顺序和排列及其调节元素 - 塑造了自然和合成基因回路的动态协调。一个基因座的转录深刻影响附近相邻基因的转录,但是这种作用的分子基础仍然很少了解。在这里,使用人类细胞中的集成报告基质电路,我们表明超串联介导的反馈以语法特异性方式调节相邻基因的表达。使用区域捕获Micro-C,我们测量了人类诱导的多能干细胞中超螺旋的plectonemes和语法特异性染色质结构的诱导依赖性形成。使用语法作为设计参数,我们构建了紧凑的基因电路,调整了各种递送方法和细胞类型的表达的平均值,方差和表达的序列。将超螺旋介导的反馈整合到基因调节模型中将扩展我们对天然系统的理解,并增强合成基因回路的设计。

基因语法定义了超螺旋介导的转录反馈

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