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摘要基于T细胞的免疫疗法彻底改变了癌症治疗,但只有少数患者对这些方法做出反应,这受到了对肿瘤特异性抗原知识有限的有限限制。在这里,我们提出了21种癌症类型的T细胞靶标的全面图,显示了86%的肿瘤可起作用的肿瘤特异性靶标。为了定义可操作的T细胞靶标的曲目,我们进行了全面的泛伴奏分析,该分析整合了来自7,473个RNA-Seq数据集,1,564个免疫肽组和208个癌症单细胞数据集的数据,将这些数据与覆盖51个组织的17,384个普通样品进行比较,将这些数据与208个癌症单细胞数据集进行了比较。我们的分析发现了88种可行的表面蛋白靶标和15,079个肿瘤特异性HLA呈现的抗原,源自21种肿瘤类型的11种不同的分子事件,为基于T-细胞的免疫疗法发育提供了全面的资源。我们重点介绍了128个有希望的新肿瘤靶标,并在五个抗原类别中验证20个目标。在未覆盖的抗原中,我们突出显示了339个以前未表征的新抗原,这是一种新的PMEL剪接肽,我们期望它是临床靶标的优质抗原,新型的自抗原,是从前未知的ORF肽衍生而来的肽,这些肽是以前未知的,不知名的蛋白质,以及新型的肿瘤蛋白质,以及新型的肿瘤特异性微生物靶标。这些发现显着扩大了T细胞疗法的治疗景观。为了催化治疗性开发,我们使我们的泛伴奏目标地图集和随附的工具包可供科学界使用,并希望这些资源为多种癌症的免疫疗法铺平道路。

T细胞目标的泛伴奏组

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