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AIM:小分子CSF1R抑制剂在临床开发中,针对癌症治疗剂的临床开发和潜在的铅优化在临床开发中对基于结构的抑制作用抑制菌落刺激因子-1受体(CSF1R),因为CSF1R是一种新型的预测性生物标记物,用于癌症的免疫疗法。方法:化合物是在分子工作环境中通过诱导的拟合对接方案建模的硅(Moe,Moe.V.2015)。CSF1R激酶(蛋白质数据库,ID 4R7H)的3维(3D)X射线结晶结构是从结构生物信息信息学(RSCB)蛋白数据库的研究合作中获得的。Edicotinib,DCC-3014,Arry-382,BLZ-945,Chiauranib,Dovitinib和Sorafenib的3D构象体是从PubChem数据库中获得的。这些结构在Amber10:EHT分子力场中进行了建模,并使用快速准备应用来纠正和优化缺失残基,H-Counts,Termini限额和交替的结构。在CSF1R激酶的共结晶配体附近定义了结合位点。这些化合物通过三角匹配器的放置方法对接,并通过伦敦DG评分函数进行排名。通过诱导的合适方法进一步完善了对接的姿势。使用最低结合评分(ΔG)的姿势用于模拟Discovery Studio Visualer V17.2中的配体相互作用曲线。共结晶的配体以其APO构象对接,并计算出根平方的偏差以验证对接协议。结果:除edicotinib以外,所有7个CSF1R抑制剂与残基MET637相互作用。抑制剂通过与ASP-Phe-Gly(DFG)基序的ASP797相互作用和/或阻碍GLU633和LYS616之间形成的保守盐桥,以自动抑制构象的构象保持CSF1R。DCC-3014,Arry-382,BLZ-945和Sorafenib与CSF1R激酶与最低的结合能结合。结论:嘧啶是与CSF1R残基相互作用的有效抑制剂。DCC-3014和Arry-382具有出色的药物潜力,具有巨大的结构稳定性和亲和力。

在构成菌落刺激因子-1受体

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