摘要简介:鼻咽癌的发病机理(NPC)是复杂的,受宿主遗传学,病毒感染和环境因素在内的因素的影响,导致遗传和表观遗传修饰。尽管对早期患者的预后呈阳性,但大多数NPC病例都在高级阶段被诊断出,这突出了增强对早期诊断和治疗的可及性的紧迫性。驱动NPC进展的潜在分子途径仍然难以捉摸。本研究的重点是使用生物信息学技术和数据库进行研究,以了解对NPC中基因相关性和潜在应用的见解。材料和方法:从2017年1月至2024年6月以英文发表的搜索,利用了“鼻咽癌”,“生物信息学”,“基因表达”和“基因微阵列”等关键字,跨越了PubMed,Medline和Scopuss。基因表达综合(GEO)数据库用于访问NPC Messenger RNA(mRNA)表达分析研究。结果:大多数研究都利用GEO数据库来鉴定正常组织和NPC组织之间差异表达的基因(DEG),然后使用基因和基因组(KEGG)途径的基因本体论(GO)和京都百科全书进行功能分析。蛋白质蛋白质相互作用(PPI)的DEG网络通常是使用字符串构建的,并使用Cytoscape软件可视化。GO和KEG途径分析与PPI网络构建以及NPC发病机理下的失调途径和分子机制的有价值的见解。微阵列分析,尤其是GSE12452,GSE64634和GSE34573等数据集,已实现了与NPC相关的DEG的识别。PPI网络分析确定了与NPC发病机理有关的轮毂基因,例如DNALI1,DNAI2和RSPH9。通过GEPIA等平台和oncomine验证基因表达模式验证了已鉴定的生物标志物的临床相关性。 此外,采用RNA测序和生物信息学方法的研究发现了与NPC无线电抗性和预后有关的新型基因,为个性化的治疗策略铺平了道路。通过GEPIA等平台和oncomine验证基因表达模式验证了已鉴定的生物标志物的临床相关性。此外,采用RNA测序和生物信息学方法的研究发现了与NPC无线电抗性和预后有关的新型基因,为个性化的治疗策略铺平了道路。
主要关键词