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鉴定沙利度胺,多纳拉替胺和莫利度胺作为脑(CRBN)粘合剂刺激了促蛋白水解靶向嵌合体(Protacs)的发展。带有CRBN结合部分的PROTAC是与CRBN形成三元复合物的异功能分子,它募集了CUL4-DDB1泛素连接酶蛋白蛋白复合物和感兴趣的蛋白质(POI),并靶向其降解。尽管进行了许多持续的努力,但基于结构的Protac设计仍然难以捉摸。当前的方法依赖于Protac库的合成并以所选测定格式筛选库来识别可行的命中,这可能是耗时的和资源密集的,强调了对更有效的筛选方法的需求。为了应对这一挑战,我们假设使用HCT116野生型(WT)POI敲除(POI - / - )和CRBN敲除(CRBN - / - )细胞的基于生存力的表型筛选系统将能够快速识别POI和CRBN依赖性方式以POI和CRBN依赖性方式显示活性。在这项研究中,我们选择了MAP3K1(一种致癌信号激活剂),作为我们的POI并使用各种接头将ATP竞争力的MAP3K1抑制剂与Thalidomide共轭,以生成库。使用上述WT,MAP3K1 - / - 和CRBN - / - 单元线对库进行3天的生存能力屏幕。屏幕将50-008识别为有选择性抑制WT细胞的生存能力而不是MAP3K1 - / - 或CRBN - / - 细胞的命中。50-008在结直肠癌细胞系和类器官模型中进行了化学验证,从而产生了影响CRBN结合,MAP3K1结合或接头的单个变化。随访研究表明,50-008抑制了癌细胞的增殖,诱导凋亡,并以CRBN和MAP3K1依赖性方式抑制了S期细胞周期停滞。此外,在约900个癌细胞系中,在50-008的混合物(PRISM)筛选中同时进行了相对抑制,鉴定出267个敏感的癌细胞系(IC 50 <0.1 µM),包括腔内B乳腺癌细胞系T47D和131个抗性癌细胞系(IC 50> 10 µM)。在T47D细胞中的机理研究表明,50-008降解MAP3K1并调节关键下游效应子(例如ERK和IKKβ)的激活。总而言之,我们的表型筛选系统,我们确定并验证了50-008是一种有效的MAP3K1靶向Protac,具有多种癌症模型的选择性活性。这种方法建立了一种快速可靠的管道,用于识别功能性protac,同时验证其细胞特异性和作用机理。我们的发现不仅为未来的Protac开发提供了验证的筛选平台,而且还为靶向MAP3K1依赖性癌症提供了治疗潜力。

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