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抽象Z-DNA是一种替代的DNA的左手螺旋形式,具有锯齿形的主链,与右手规范的B-DNA螺旋不同。Z-DNA已与各种生物学过程有关,包括转录,复制和DNA修复,并可以诱导遗传不稳定性。交替的嘌呤和嘧啶的重复序列具有采用Z-DNA结构的潜力。Zseeker是一种开发的新型计算工具,用于准确检测基因组中潜在的Z-DNA形成序列,从而解决了先前方法的局限性。通过引入一种通过实验数据知情和验证的新方法,Zseeker可以很好地检测潜在的Z-DNA形成序列。同时构建了独立的Python软件包,又是可访问的Web界面,Zseeker允许用户通过可下载的可视化来输入基因组序列,调整检测参数并查看潜在的Z-DNA序列分布和Z分数。我们的Web平台提供了用于Z-DNA标识的无代码解决方案,重点是可访问性,用户友好性,速度和自定义性。通过提供有效的高通量分析和增强的检测准确性,Zseeker具有支持在理解Z-DNA在正常细胞功能,遗传不稳定性及其在人类疾病中的影响方面的作用方面的重大进步。可用性:Zseeker以GPL许可证作为多平台应用程序作为Python包发行,可在以下网址获得:https://github.com/georgakopoulos-soares-soares-lab/zseeker。Zseeker的Web-Interface可在https://zseeker.netlify.app/上公开获得。关键字:Z-DNA,算法设计,搜索工具,Web接口

Zseeker:一种用于基因组序列中Z-DNA检测的优化算法

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