碳捕获是从大气中去除二氧化碳(CO 2)的碳捕获,它引起了人们的注意,以减轻全球变暖的影响。植物和光营养微生物具有通过CO 2固定捕获碳以产生生物量的固有能力。然而,天然碳固定途径受到催化活性低的关键酶的限制,导致低能效率。Rubisco就是一种关键酶,以其表现不佳而臭名昭著。过去的研究未能通过常规方法来增强Rubisco的碳固定。生成建模已成为一种创新的酶工程方法,利用不同的神经网络体系结构来提出具有期望特征的新型变体。在这里,将在Rubisco序列空间训练的变异自动编码器(VAE)应用于Rubisco Engineering的挑战。训练了两种模型,并使用VAE的降低性降低特性,探索了Rubisco的健身景观。序列用催化相关的数据标记,并建立回归模型,目的是预测这些序列具有增强的催化活性。在对低维空间进行系统审查后,生成了新型Rubisco序列。这里使用生成建模提供了Rubisco工程的新观点。
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