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尽管已经出现了抗体-药物偶联物等生物制剂 [2,5],但分子医学的未来仍依赖于小分子效应物的识别和验证 [1-4]。事实上,特定的药物-靶标结合和参与仍然是调节和治疗疾病的标志。生物活性物质很少针对特定靶标进行选择性结合,而是通过所谓的多药理学或网络药理学 [8,9] 与其他几种相关或不相关的大分子 [6,7] 相互作用。虽然在某些情况下,例如癌症,希望利用调节大量靶标(理想情况下属于不同的信号通路 [10])的疗法的潜力,但一般来说,多药理学是不受欢迎的,因为它是药物不良反应的罪魁祸首 [11,12]。因此,了解与化学物质的功效和责任相关的靶标和脱靶的事实对于最大限度地发挥效益和减少开发流程中的损耗至关重要。

机器学习在药物开发中的目标发现

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