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自由能计算的民主化伴随着大量算法的出现，这些算法不仅有助于提高可靠性，也有助于提高方法的效率，但不幸的结果是造成了混乱，新手和专家都感到困惑，为什么看似相似的方法在进行比较时会导致截然不同的结果，也不知道在他们感兴趣的具体案例中哪种方法最适合。尽管这些方法的名称截然不同，但它们在概念上往往是相关的，并基于一些基本思想，这些思想可以追溯到该领域的先驱，如 De Donder (15)、Peierls (16)、Landau (17, 18)、Kirkwood (19)、Zwanzig (20) 或 Valleau (21, 22)。尽管如此，解决给定问题的最佳方法问题仍然非常重要，应该用最具成本效益的算法或两者的组合来重新表述，以获得可靠的答案。从应用的角度来看，自由能计算可以分为几何变换和炼金术变换。前者直接作用于化学对象的空间坐标以修改其位置、方向和构象状态，而后者利用势能函数的可塑性来
药物研发中的自由能方法——简介
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