甲基化等表观遗传机制可以影响基因表达,并在适应当地环境条件方面发挥关键作用,从而引入物种内的非遗传变异性。在这里,我们使用简化表示亚硫酸氢盐测序方法 (RRBS),比较了三个欧洲棕熊种群的血液和肌肉中的甲基化模式。我们的结果清楚地表明,除了组织驱动的分歧之外,三个种群的甲基化模式明显不同。差异甲基化位点可能与涉及发育和解剖分化的基因组特征有关,遍布整个熊基因组。这一发现支持了先前的研究,即改变发育途径在塑造具有潜在适应性意义的表型新颖性方面发挥着作用。我们的研究结果强调了在研究野生非模型生物时纳入表观遗传方法的重要性和有效性。研究表观基因组对于那些基因组多样性已严重丧失的濒危种群尤其重要。