人类遗传学是加速目标选择并增加药物开发成功的可能性的强大工具。对疾病的遗传基础的越来越多的理解提供了识别可能针对潜在分子病理和发展疾病修饰疗法的靶标。在这里,我们开发了一个工作流程,以测试来自高吞吐量筛选(HTS)中人类遗传学的感兴趣基因(GOI)。使用有关心脏结构,功能和疾病风险的公开可用的人遗传数据,我们优先考虑100多个心肌病疾病的靶标。siRNA和AAV-ORF文库,以促进人类诱导的多能干细胞衍生的心肌细胞(HIPSC-CMS)和心脏成纤维细胞(CF)中这些基因的敲低或过表达。开发了两个定制的MATLAB HTS图像处理脚本,称为“ tamarack”和“豪猪”,用于量化HIPSC-CM肉瘤形态和CF激活,分别使用小波转换来检测亚细胞结构。tamarack可以量化肌节计数,长度和方向。豪猪能够定量成纤维细胞激活指标,包括α-平滑肌肌动蛋白,应力纤维计数,长度,方向,核α-SMA重叠和F-肌动蛋白α-SMA重叠。我们确定了CM和CF屏幕的最高命中,以进行进一步的分析。
主要关键词