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微生物来自油储层的微生物通过生物降解或酸化等过程形成石油成分。此类过程在经济上被认为是有害的,可能会构成健康和安全危害。因此,了解储层微生物群落及其代谢能力的组成至关重要。然而,这种分析受到困难,从而从诸如原油等复杂流体中提取DNA。在这里,我们提出了一种新型的DNA提取方法,该方法具有广泛的美国石油研究所(API)重力(密度)范围。我们研究了从具有不同溶剂和表面活性剂的油中提取细胞的能力,后者均非离子和离子。此外,我们评估了三种DNA提取方法。总体而言,使用异辛烷作为溶剂来实现最佳的DNA产量和16S rRNA读数的数量最高,然后使用十二烷基硫酸钠和使用Powersoil Pro Kit(Qiagen)进行了离子表面活性剂处理。然后将最终方法应用于在无菌条件下收集的油库中的各种油。尽管预期的低细胞密度为10 1 - 10 3个细胞/ml,但新方法仍产生可靠的结果,平均16S rRNA测序读取为41431(±8860)的顺序。嗜热,嗜热和厌氧分类群,最有可能是油储层的土著。API重力和DNA产量却没有显示出相关性。

原油的基于异辛烷的基于异辛烷的DNA提取方法

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