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解锁罕见疾病遗传学:全基因组关联研究和单核苷酸多态性的见解Osama Alam* 1,卫生汗2,Azmat Ullah 1 1 1 1 1 1科学与技术大学生物技术系Bannu Bannu,28100 Khyber Pakhtunkhwa,Pakhtunkhwa,Pakhthwa,pakistan。2 govt动物学系。巴基斯坦班努大学研究生学院。摘要:全基因组关联研究(GWAS)是识别与复杂疾病相关的遗传变异的强大工具。然而,由于这些疾病通常涉及低频基因突变,因此它们的效用在阐明稀有疾病的遗传学方面受到限制。代表基因组中单碱基对变化的单核苷酸多态性(SNP)可以为稀有疾病的遗传结构提供宝贵的见解。值得注意的是,诸如APP,PSEN1,PSEN2,APOE,TREM2和ABCA7之类的基因中的特定SNP揭示了阿尔茨海默氏病(AD)的分子基础。App Gene中的SNP RS429358中,通过改变淀粉样蛋白β的产生,与阿尔茨海默氏症的风险增加相关。同样,通过GWAS发现的SNP与慢性阻塞性肺疾病易感性(COPD),纤维肿瘤肿瘤易感性(FOP)和Hutchinson-Gilford综合征(HGPS)联系起来,也表现出ACVR1和LMNA中引起疾病​​的突变。然而,由于招募大型队列的挑战,GWAS进行了有力的罕见疾病,这给人带来了困难。标准GWAS工作流程涉及患者入学,基因组DNA提取,基因分型和严格的质量控制。案例和对照进行匹配和分析,并进行多次测试的校正。罕见的变体方法和插入旨在增强统计能力的目的。关键障碍包括样本量不足,遗传异质性和罕见的因果变体。缓解策略结合了跨国联盟,基于家庭的设计,功能分析,下一代测序,定制基因面板和机器学习方法。前进的GWA将需要越来越大,多样化的数据集,以及新颖的统计和高通量的OMIC技术,以破译稀有和复杂病理的遗传根。

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