机构名称：
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图1：热点模拟方法。我们通过将其应用于Musashi-1的RRM1域来证明这种方法。（a）MSI1 / RNA复合物的结构。RNA（棍棒）围绕蛋白质包裹（球形）。将两个相邻的碱基A106和G107（洋红色）埋在蛋白质表面的浅口袋中。（b）通过收集涉及分子间氢键的深埋碱（洋红色）和原子（以黄色显示的供体，绿色供体显示），从复合物中的RNA产生了相互作用图。（c）相互作用图的组成部分聚集在空间中，不参与氢键的原子将其恢复为碳原子。这会产生“热点药理”。 （d）通过与荧光标记的RNA竞争确定的带有单个无碱性位点与原始同源RNA序列的RNA之间结合自由能的差异。正值表明当给定基碱被无碱位点替换时，结合减少，表明A106和G107对这种相互作用的结合亲和力的贡献大于附近的其他碱基。（e）热点药效团是基于配体筛选的模板，寻找可以模仿药效团的三维特征的化合物。屏幕导致化合物R12的鉴定，该复合R12模拟了环的几何形状，并提供了四个所需的氢键组中的三个。（F）R12与荧光素标记的RNA竞争MSI1结合，如通过荧光极化测定所观察到的。这些数据不允许确定结合亲和力。（g）热点药效团回到蛋白质结构上的叠加说明了应由理想配体捕获的相互作用：针对三个芳族侧级堆叠，以及四个分子间氢键。（H）R12在蛋白质结构上的叠加表明，该化合物有望保留芳香族堆积，并概括了四个氢键中的三个。
通过热点模仿的墨西哥蛋白RNA相互作用的合理设计的抑制剂
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