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摘要:尽管最近取得了进展,但 CRISPR/Cas9 在多年生植物中的应用仍有许多障碍需要克服。我们之前在苹果和梨中使用 CRISPR/Cas9 的结果表明,在编辑赋予白化表型的八氢番茄红素去饱和酶 (PDS) 基因后,经常产生表型和基因型嵌合体。因此,我们的第一个目标是确定从原代转基因植物 (T0) 的叶子中添加不定芽再生步骤是否可以减少嵌合体。在从杂色 T0 系再生的数百个不定芽中,89% 是同质白化。此外,对其中 12 个再生系(RT0 为“再生 T0”系)的靶区序列的分析表明,99% 的 RT0 等位基因预测会产生截短的靶蛋白,67% 的 RT0 植物的异质性编辑谱比 T0 少。碱基编辑器是 CRISPR/Cas9 衍生的新型基因组编辑工具,可进行精确的核苷酸替换而不会造成双链断裂。因此,我们的第二个目标是证明使用两个易于评分的基因在苹果和梨中进行 CRISPR/Cas9 碱基编辑的可行性:乙酰乳酸合酶 - ALS(赋予对氯磺隆的抗性)和 PDS。MdU3 和 MdU6 启动子下的两个引导 RNA 被偶联到含有与切口酶 Cas9 融合的胞苷脱氨酶的胞苷碱基编辑器中。使用这个载体;我们在目标基因中诱导了 C 到 T 的 DNA 替换;导致氨基酸序列发生离散变异并产生新的等位基因。通过共同编辑 ALS 和 PDS 基因;我们成功获得了抗氯磺隆和白化梨系。总体而言;我们的工作表明,再生步骤可以有效减少初始嵌合现象,并且可以与碱基编辑的应用相结合,在多年生植物中创建准确的基因组编辑。

高效去嵌合化和碱基编辑

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