摘要 目的:细胞异质性被认为是影响恶性黑色素瘤治疗反应和耐药性的主要因素。单细胞测序技术的最新发展为这些机制提供了更深入的见解。方法:在这里,我们通过单细胞 RNA 测序分析了不同条件下的 BRAF V600E 突变黑色素瘤细胞系:对 BRAF 抑制剂维莫非尼抑制 BRAF 敏感的细胞和对单独使用维莫非尼或维莫非尼与 MEK1/2 抑制剂考比替尼或曲美替尼联合使用 BRAF 抑制产生耐药性的细胞。通过 t 分布随机邻域嵌入和自组织映射进行降维,确定了不同的耐药性发展轨迹,在细胞和基因状态空间中将 4 种治疗条件清楚地分开。结果:与单一药物治疗耐药性相关的轨迹涉及细胞周期、细胞外基质和去分化程序。相反,在双重耐药细胞中检测到的变化主要影响翻译和丝裂原活化蛋白激酶途径的再激活,其中一小部分亚群显示出多能性标志。这些发现在伪时间分析和 RNA 速度测量中得到了验证。结论:本文报道的单细胞转录组分析采用了一系列生物信息学方法来识别黑色素瘤对单一和双重药物治疗的耐药机制。这项研究加深了我们对治疗诱导的黑色素瘤细胞重编程和可塑性的理解,并确定了与治疗耐药性管理可能相关的目标。关键词黑色素瘤;单细胞转录组测序;治疗反应
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